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Covid-19 : le R effectif (R0), un indicateur de réussite du confinement

1 Nov. 2020

Depuis le début de l’épidémie de coronavirus (en janvier 2020 en Asie) on parle beaucoup du R effectif, un indicateur présenté comme le reflet de la vitesse de propagation du Sars-Cov-2, le virus responsable de la maladie Covid-19. Mais de quoi s’agit-il exactement ?

En langage médical, on dit que le R0 ou R effectif correspond au taux de reproduction de base d’un virus. En clair : « il s’agit du nombre de personnes qui peuvent potentiellement être contaminées par un individu infecté par un virus » explique le Dr. William Berrebi, gastro-entérologue et hépatologue, et ancien interne des Hôpitaux de Paris.

L’indicateur R0 n’est donc pas spécifique au coronavirus Sars-Cov-2 : on peut le mesurer pour n’importe quelle épidémie virale. « Au plus fort de l’épidémie de coronavirus, à la fin du mois de mars 2020, le R0 était de 3 ce qui signifie que chaque personne infectée pouvait transmettre le virus à environ 3 autres personnes, affirme le Dr. Berrebi. À titre de comparaison, le R0 de la rougeole est de 16 et celui de la gastro-entérite est de 17 : ce sont des virus qui circulent beaucoup plus facilement que le Sars-Cov-2 dans la population.« 

Dans le contexte de reconfinement en vigueur depuis vendredi, l’Institut Pasteur envisage plusieurs scénarios selon que les mesures de restriction des contacts sociaux seront bien respectées ou un peu moins suivies par la population et donc moins efficaces. L’indicateur de réussite de ce nouveau confinement est donc comme au printemps dernier le chiffre R. Si les mesures de confinement sont appliquées comme lors du premier confinement, il pourrait baisser à 0,7, mais rester autour de 1,2 dans le cas contraire. L’Institut Pasteur est parti sur un R entre les deux, à 0,9 pour faire établir des estimations. Dans ce cas, le pic des admissions à l’hôpital pourrait être atteint mi-novembre.

Le R effectif (R0) du coronavirus région par région : il est « significatif » partout sauf en Corse

Quelques repères. Lorsque le R0 d’une épidémie tombe à 0, le virus ne circule plus et l’épidémie s’éteint : a contrario, plus il est élevé, plus l’épidémie prend de l’ampleur. « Lorsque le R0 dépasse 1, on estime que l’épidémie est active : à l’époque, cela correspondait aux départements en orange sur la carte de France, note le Dr. Berrebi. Lorsqu’il atteint 1,5, c’est un seuil d’alerte. »

Le 11 juin 2020, le R0 du Sars-Cov-2 est tombé à 0,73 « surtout grâce aux mesures de confinement » estime le Dr. Berrebi.

Au 29 octobre, le R effectif est significativement supérieur à 1 et au augmentation ces dernières semaines. Pour le calculer, Santé Publique France s’appuie sur trois types de données : données virologiques (tests), hospitalisations et passages aux urgences.

En France métropolitaine, le nombre de reproduction calculé à partir des données virologiques est de 1,42. Celui calculé à partir des données d’hospitalisations est de 1,42. Enfin, celui calculé avec les données de passages aux urgences est de 1,38. Tous sont donc supérieurs à 1, et ce dans toutes les régions, à l’exception de la Bretagne.

  • L’indicateur étant supérieur à 1, cela signifie qu’une personne infectée en contamine une autre et que par conséquent que l’épidémie progresse en France.
  • Les R sont significatifs dans toutes les régions à l’exception de la Corse.

Régions

R effectif (PCR)

R effectif (urgences)

R effectif (hospitalisations)

Auvergne-Rhône-Alpes

1,53

1,51

1,52

Bourgogne-Franche-Comté

1,60

1,49

1,73

Bretagne

1,42

1,15

1,38

Centre-Val de Loire

1,62

1,35

1,39

Corse

1,38

1,32

1,74

Grand Est

1,71

1,54

1,61

Hauts-de-France

1,43

1,35

1,40

Ile-de-France

1,17

1,24

1,23

Normandie

1,39

1,34

1,38

Nouvelle-Aquitaine

1,57

1,57

1,57

Occitanie

1,40

1,39

1,32

Pays de la Loire

1,52

1,23

1,61

Provence-Alpes-Côte d’Azur

1,48

1,49

1,53

Guadeloupe

0,60

0,92

0,51

Guyane

1,16

1,47

La Réunion

1,33

1,06

1,52

Martinique

1,27

1,04

Mayotte

1,44

Le « R » ou taux de reproduction expliqué en VIDEO

Coronavirus : comment faire descendre le R0 ?

La remontée du R0 correspond à un relâchement des gestes-barrières dans la population. Il est très important de porter impérativement un masque de protection lors des déplacements et respecter tous les gestes barrière (lavage des mains, distance, aération…) pour limiter la propagation du virus responsable du Covid-19.

Autre stratégie efficace : tester et isoler chaque malade atteint par le Covid-19 : « si on identifie suffisamment tôt les personnes contaminées à l’aide de tests, on peut (en quelque sorte) sortir ces personnes du circuit et les empêcher de contaminer leur entourage, évitant ainsi une propagation du R0 » – il s’agit là de la stratégie recommandée par l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS).

Mais pour le spécialiste, il est probable que seule la vaccination permettra véritablement d’éteindre l’épidémie de coronavirus : « c’est grâce à la vaccination que le R0 de la grippe saisonnière est tombé à 0,5 : il est donc très vraisemblable qu’en attendant la vaccination contre le Covid-19, on constate des oscillations permanentes au niveau de cet indicateur-clé« .

Merci au Dr. William Berrebi, gastro-entérologue et hépatologue, ancien interne des Hôpitaux de Paris, auteur du podcast Merci Docteur ! et de Virus-animaux-humains : des liaisons (très) dangereuses – Du SIDA au Covid-19.

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Source: https://www.topsante.com/feed/list/rss/(limit)/30 – Topsante.com

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