Coronavirus : quel est le R effectif (R0) région par région en France ?

Depuis le début de l'épidémie de coronavirus (en janvier 2020 en Asie) on parle beaucoup du R effectif, un indicateur présenté comme le reflet de la vitesse de propagation du Sars-Cov-2, le virus responsable de la maladie Covid-19. Mais de quoi s'agit-il exactement ?

En langage médical, on dit que le R0 ou R effectif correspond au taux de reproduction de base d'un virus. En clair : "il s'agit du nombre de personnes qui peuvent potentiellement être contaminées par un individu infecté par un virus" explique le Dr. William Berrebi, gastro-entérologue et hépatologue, et ancien interne des Hôpitaux de Paris.

L'indicateur R0 n'est donc pas spécifique au coronavirus Sars-Cov-2 : on peut le mesurer pour n'importe quelle épidémie virale. "Au plus fort de l'épidémie de coronavirus, à la fin du mois de mars 2020, le R0 était de 2,8 ce qui signifie que chaque personne infectée pouvait transmettre le virus à environ 3 autres personnes, affirme le Dr. Berrebi. À titre de comparaison, le R0 de la rougeole est de 16 et celui de la gastro-entérite est de 17 : ce sont des virus qui circulent beaucoup plus facilement que le Sars-Cov-2 dans la population."

Le R effectif (R0) du coronavirus région par région : supérieur à 1 dans 9 régions

Quelques repères. Lorsque le R0 d'une épidémie tombe à 0, le virus ne circule plus et l'épidémie s'éteint : a contrario, plus il est élevé, plus l'épidémie prend de l'ampleur. "Lorsque le R0 dépasse 1, on estime que l'épidémie est active : à l'époque, cela correspondait aux départements en orange sur la carte de France, note le Dr. Berrebi. Lorsqu'il atteint 1,5, c'est un seuil d'alerte : cela correspondait aux départements en rouge."

Le 11 juin 2020, le R0 du Sars-Cov-2 est tombé à 0,73 "surtout grâce aux mesures de confinement" estime le Dr. Berrebi.

Aujourd'hui, au 17 juillet, le R effectif atteint la limite critique puisqu'il dépasse 1 : il est entre 1,12 (selon données de passages aux urgences) et 1,18 (selon données virologiques obtenues avec les résultats des tests PCR), indique le dernier bulletin épidémiologique hebdomadaire de Santé Publique France. Ceci indique que la transmission de l’infection à SARS-CoV-2 est en progression.

• L’indicateur étant supérieur à 1, cela signifie qu’une personne infectée en contamine une autre et que par conséquent que l'épidémie progresse en France.
• Les R effectifs sont significatifs dans 3 régions :  Provence-Alpes-Côte d'Azur, Pays de la Loire et Ile-de-France.
• Le R effectif calculé à partir des passages aux urgences est significatif dans 3 régions supplémentaires mais sans que le R effectif calculé à partir des tests PCR ne soit significativement supérieur à 1 : Auvergne-Rhône-Alpes, Nouvelle-Aquitaine et Bretagne.
• Les régions Bourgogne-Franche-Comté, Centre-Val de Loire, Haut-de-France et Occitanie ont des R effectifs supérieurs à 1 mais non significatifs.

Coronavirus : comment faire descendre le R0 ?

"La remontée du R0 correspond, selon moi, à un relâchement des gestes-barrières dans la population : en consultation, on voit certains patients sans masques de protection, affirme le Dr. Berrebi. Mon conseil est très simple : portez impérativement un masque de protection lorsque vous vous rendez dans un espace fermé (magasin, restaurant, cabinet médical...) pour limiter la propagation du virus responsable du Covid-19."

Autre stratégie efficace : tester et isoler chaque malade atteint par le Covid-19 : "si on identifie suffisamment tôt les personnes contaminées à l'aide de tests, on peut (en quelque sorte) sortir ces personnes du circuit et les empêcher de contaminer leur entourage, évitant ainsi une propagation du R0" - il s'agit là de la stratégie recommandée par l'Organisation Mondiale de la Santé (OMS) !

Mais pour le spécialiste, il est probable que seule la vaccination permettra véritablement d'éteindre l'épidémie de coronavirus : "c'est grâce à la vaccination que le R0 de la grippe saisonnière est tombé à 0,5 : il est donc très vraisemblable qu'en attendant la vaccination contre le Covid-19, on constate des oscillations permanentes au niveau de cet indicateur-clé".

Merci au Dr. William Berrebi, gastro-entérologue et hépatologue, ancien interne des Hôpitaux de Paris, auteur du podcast Merci Docteur ! et de Virus-animaux-humains : des liaisons (très) dangereuses - Du SIDA au Covid-19.

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